Protein–RNA interactions for Protein: Q32MK0

MYLK3, Myosin light chain kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 819 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYLK3Q32MK0 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MYLK3Q32MK0 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MYLK3Q32MK0 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MYLK3Q32MK0 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
MYLK3Q32MK0 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MYLK3Q32MK0 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MYLK3Q32MK0 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MYLK3Q32MK0 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MYLK3Q32MK0 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MYLK3Q32MK0 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MYLK3Q32MK0 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MYLK3Q32MK0 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MYLK3Q32MK0 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MYLK3Q32MK0 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MYLK3Q32MK0 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MYLK3Q32MK0 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MYLK3Q32MK0 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MYLK3Q32MK0 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MYLK3Q32MK0 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MYLK3Q32MK0 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MYLK3Q32MK0 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MYLK3Q32MK0 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MYLK3Q32MK0 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms