Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms