Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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