Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UPP1Q16831 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms