Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
PCK2Q16822 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms