Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms