Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
USF2Q15853 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
USF2Q15853 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
USF2Q15853 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
USF2Q15853 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
USF2Q15853 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
USF2Q15853 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
USF2Q15853 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
USF2Q15853 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
USF2Q15853 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
USF2Q15853 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
USF2Q15853 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
USF2Q15853 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
USF2Q15853 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
USF2Q15853 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
USF2Q15853 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
USF2Q15853 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
USF2Q15853 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
USF2Q15853 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
USF2Q15853 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
USF2Q15853 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
USF2Q15853 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
USF2Q15853 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
USF2Q15853 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
USF2Q15853 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
USF2Q15853 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
USF2Q15853 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
USF2Q15853 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
USF2Q15853 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
USF2Q15853 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
USF2Q15853 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
USF2Q15853 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
USF2Q15853 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
USF2Q15853 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
USF2Q15853 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
USF2Q15853 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
USF2Q15853 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
USF2Q15853 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
USF2Q15853 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
USF2Q15853 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
USF2Q15853 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
USF2Q15853 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
USF2Q15853 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
USF2Q15853 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
USF2Q15853 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
USF2Q15853 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
USF2Q15853 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
USF2Q15853 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
USF2Q15853 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
USF2Q15853 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
USF2Q15853 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
USF2Q15853 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
USF2Q15853 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
USF2Q15853 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
USF2Q15853 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
USF2Q15853 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
USF2Q15853 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
USF2Q15853 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
USF2Q15853 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
USF2Q15853 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
USF2Q15853 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
USF2Q15853 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
USF2Q15853 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
USF2Q15853 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
USF2Q15853 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
USF2Q15853 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
USF2Q15853 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
USF2Q15853 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF2Q15853 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF2Q15853 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF2Q15853 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF2Q15853 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF2Q15853 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF2Q15853 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF2Q15853 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF2Q15853 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF2Q15853 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF2Q15853 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF2Q15853 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF2Q15853 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF2Q15853 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF2Q15853 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF2Q15853 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF2Q15853 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF2Q15853 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF2Q15853 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF2Q15853 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF2Q15853 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
USF2Q15853 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF2Q15853 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF2Q15853 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF2Q15853 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
USF2Q15853 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF2Q15853 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF2Q15853 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF2Q15853 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF2Q15853 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF2Q15853 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF2Q15853 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USF2Q15853 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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