Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 CACNA1G-219ENST00000507609 6849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
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VAMP3Q15836 RALGAPB-203ENST00000397042 8652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 SLX4-201ENST00000294008 7307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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VAMP3Q15836 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
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VAMP3Q15836 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
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VAMP3Q15836 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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VAMP3Q15836 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
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VAMP3Q15836 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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VAMP3Q15836 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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VAMP3Q15836 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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VAMP3Q15836 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
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VAMP3Q15836 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 SRPK3-208ENST00000489426 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 AC090114.2-201ENST00000608477 7054 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
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