Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
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