Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCM1Q15154 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms