Protein–RNA interactions for Protein: Q15119

PDK2, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK2Q15119 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDK2Q15119 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms