Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CBFBQ13951 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CBFBQ13951 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CBFBQ13951 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CBFBQ13951 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CBFBQ13951 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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CBFBQ13951 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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CBFBQ13951 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CBFBQ13951 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CBFBQ13951 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CBFBQ13951 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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