Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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