Protein–RNA interactions for Protein: Q13442

PDAP1, 28 kDa heat- and acid-stable phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDAP1Q13442 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 AC106872.6-201ENST00000514228 1346 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 ETFRF1-201ENST00000381356 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 AC007991.4-201ENST00000522970 605 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 ZNF506-204ENST00000545006 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 AC139099.1-201ENST00000573737 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 AC069503.1-202ENST00000616576 642 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 AC073578.4-201ENST00000623945 514 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 AL732372.1-203ENST00000635159 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 AL354892.3-201ENST00000586101 1630 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms