Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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