Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFT88Q13099 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
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