Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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GPS1Q13098 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
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