Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MKRN3Q13064 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 AL034417.3-201ENST00000641100 1043 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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