Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms