Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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