Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSRP1Q08945 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms