Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CD47Q08722 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD47Q08722 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD47Q08722 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD47Q08722 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD47Q08722 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD47Q08722 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD47Q08722 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD47Q08722 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD47Q08722 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD47Q08722 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD47Q08722 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD47Q08722 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD47Q08722 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD47Q08722 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD47Q08722 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD47Q08722 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD47Q08722 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD47Q08722 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CD47Q08722 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD47Q08722 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD47Q08722 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD47Q08722 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD47Q08722 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD47Q08722 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD47Q08722 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD47Q08722 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD47Q08722 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CD47Q08722 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD47Q08722 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD47Q08722 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD47Q08722 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD47Q08722 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD47Q08722 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD47Q08722 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD47Q08722 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD47Q08722 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD47Q08722 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD47Q08722 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD47Q08722 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD47Q08722 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD47Q08722 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD47Q08722 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD47Q08722 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD47Q08722 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD47Q08722 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD47Q08722 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD47Q08722 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CD47Q08722 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD47Q08722 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD47Q08722 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD47Q08722 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD47Q08722 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD47Q08722 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD47Q08722 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD47Q08722 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD47Q08722 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD47Q08722 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD47Q08722 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD47Q08722 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD47Q08722 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD47Q08722 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD47Q08722 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD47Q08722 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD47Q08722 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD47Q08722 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD47Q08722 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD47Q08722 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD47Q08722 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CD47Q08722 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CD47Q08722 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CD47Q08722 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CD47Q08722 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD47Q08722 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD47Q08722 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD47Q08722 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD47Q08722 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD47Q08722 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD47Q08722 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD47Q08722 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD47Q08722 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD47Q08722 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD47Q08722 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD47Q08722 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD47Q08722 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD47Q08722 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD47Q08722 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD47Q08722 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD47Q08722 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD47Q08722 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD47Q08722 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD47Q08722 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD47Q08722 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD47Q08722 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD47Q08722 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD47Q08722 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD47Q08722 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD47Q08722 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD47Q08722 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD47Q08722 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms