Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms