Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms