Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIN1Q05586 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms