Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACVR1Q04771 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms