Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms