Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 POLR2F-213ENST00000606538 760 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 AC019117.2-202ENST00000635900 1476 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 AC003075.1-208ENST00000415246 596 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 AL355493.1-201ENST00000422707 808 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 AC007785.3-202ENST00000601033 518 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 SFR1-201ENST00000369727 1438 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms