Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms