Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms