Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms