Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIM1P81133 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIM1P81133 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIM1P81133 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIM1P81133 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIM1P81133 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SIM1P81133 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIM1P81133 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIM1P81133 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIM1P81133 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SIM1P81133 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIM1P81133 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIM1P81133 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIM1P81133 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIM1P81133 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIM1P81133 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIM1P81133 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIM1P81133 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIM1P81133 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIM1P81133 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIM1P81133 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIM1P81133 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIM1P81133 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIM1P81133 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIM1P81133 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIM1P81133 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIM1P81133 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIM1P81133 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SIM1P81133 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIM1P81133 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIM1P81133 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIM1P81133 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIM1P81133 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SIM1P81133 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIM1P81133 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIM1P81133 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SIM1P81133 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIM1P81133 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIM1P81133 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIM1P81133 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIM1P81133 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIM1P81133 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIM1P81133 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIM1P81133 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIM1P81133 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIM1P81133 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIM1P81133 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIM1P81133 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIM1P81133 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIM1P81133 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SIM1P81133 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SIM1P81133 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SIM1P81133 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIM1P81133 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIM1P81133 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SIM1P81133 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SIM1P81133 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SIM1P81133 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIM1P81133 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIM1P81133 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIM1P81133 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIM1P81133 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIM1P81133 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIM1P81133 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIM1P81133 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIM1P81133 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIM1P81133 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIM1P81133 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIM1P81133 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIM1P81133 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIM1P81133 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIM1P81133 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIM1P81133 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIM1P81133 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIM1P81133 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIM1P81133 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIM1P81133 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIM1P81133 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SIM1P81133 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIM1P81133 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIM1P81133 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIM1P81133 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIM1P81133 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIM1P81133 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIM1P81133 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIM1P81133 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIM1P81133 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIM1P81133 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIM1P81133 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIM1P81133 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIM1P81133 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIM1P81133 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIM1P81133 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SIM1P81133 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIM1P81133 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIM1P81133 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIM1P81133 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIM1P81133 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIM1P81133 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SIM1P81133 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms