Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL8P80075 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL8P80075 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL8P80075 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL8P80075 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL8P80075 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL8P80075 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL8P80075 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL8P80075 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL8P80075 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL8P80075 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL8P80075 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL8P80075 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL8P80075 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL8P80075 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL8P80075 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL8P80075 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL8P80075 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL8P80075 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL8P80075 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL8P80075 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL8P80075 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL8P80075 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL8P80075 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL8P80075 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL8P80075 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL8P80075 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL8P80075 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL8P80075 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL8P80075 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL8P80075 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL8P80075 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL8P80075 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL8P80075 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL8P80075 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL8P80075 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL8P80075 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL8P80075 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL8P80075 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL8P80075 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL8P80075 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL8P80075 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL8P80075 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL8P80075 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL8P80075 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL8P80075 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL8P80075 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL8P80075 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL8P80075 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL8P80075 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL8P80075 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL8P80075 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL8P80075 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL8P80075 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL8P80075 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL8P80075 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL8P80075 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL8P80075 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL8P80075 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL8P80075 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL8P80075 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL8P80075 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL8P80075 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL8P80075 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL8P80075 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL8P80075 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL8P80075 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL8P80075 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL8P80075 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL8P80075 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL8P80075 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL8P80075 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL8P80075 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL8P80075 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL8P80075 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL8P80075 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL8P80075 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL8P80075 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL8P80075 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL8P80075 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL8P80075 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL8P80075 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL8P80075 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL8P80075 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL8P80075 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL8P80075 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL8P80075 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL8P80075 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL8P80075 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL8P80075 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL8P80075 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL8P80075 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL8P80075 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL8P80075 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL8P80075 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL8P80075 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL8P80075 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL8P80075 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CCL8P80075 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CCL8P80075 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms