Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms