Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCE1P61221 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms