Protein–RNA interactions for Protein: P58304

VSX2, Visual system homeobox 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2P58304 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VSX2P58304 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VSX2P58304 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSX2P58304 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSX2P58304 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSX2P58304 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSX2P58304 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSX2P58304 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSX2P58304 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSX2P58304 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSX2P58304 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSX2P58304 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSX2P58304 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSX2P58304 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSX2P58304 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSX2P58304 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSX2P58304 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSX2P58304 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSX2P58304 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSX2P58304 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VSX2P58304 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSX2P58304 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VSX2P58304 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSX2P58304 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSX2P58304 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSX2P58304 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSX2P58304 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSX2P58304 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSX2P58304 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSX2P58304 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSX2P58304 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSX2P58304 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSX2P58304 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSX2P58304 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSX2P58304 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSX2P58304 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSX2P58304 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSX2P58304 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSX2P58304 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSX2P58304 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSX2P58304 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSX2P58304 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSX2P58304 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VSX2P58304 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSX2P58304 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSX2P58304 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSX2P58304 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSX2P58304 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSX2P58304 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSX2P58304 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSX2P58304 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VSX2P58304 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSX2P58304 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSX2P58304 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSX2P58304 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSX2P58304 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VSX2P58304 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSX2P58304 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSX2P58304 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VSX2P58304 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSX2P58304 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSX2P58304 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSX2P58304 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSX2P58304 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSX2P58304 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSX2P58304 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSX2P58304 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSX2P58304 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSX2P58304 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSX2P58304 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSX2P58304 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSX2P58304 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSX2P58304 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSX2P58304 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSX2P58304 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSX2P58304 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSX2P58304 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSX2P58304 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSX2P58304 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSX2P58304 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSX2P58304 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSX2P58304 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSX2P58304 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSX2P58304 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSX2P58304 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSX2P58304 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSX2P58304 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSX2P58304 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VSX2P58304 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSX2P58304 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSX2P58304 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSX2P58304 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSX2P58304 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSX2P58304 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSX2P58304 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSX2P58304 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSX2P58304 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSX2P58304 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSX2P58304 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSX2P58304 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms