Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms