Protein–RNA interactions for Protein: P55055

NR1H2, Oxysterols receptor LXR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H2P55055 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR1H2P55055 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms