Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms