Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLCSP50747 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLCSP50747 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLCSP50747 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLCSP50747 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLCSP50747 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLCSP50747 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLCSP50747 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLCSP50747 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLCSP50747 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLCSP50747 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HLCSP50747 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLCSP50747 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLCSP50747 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLCSP50747 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLCSP50747 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLCSP50747 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLCSP50747 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLCSP50747 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLCSP50747 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLCSP50747 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLCSP50747 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLCSP50747 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLCSP50747 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLCSP50747 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLCSP50747 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLCSP50747 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLCSP50747 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLCSP50747 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLCSP50747 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLCSP50747 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLCSP50747 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLCSP50747 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLCSP50747 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HLCSP50747 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLCSP50747 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLCSP50747 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLCSP50747 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLCSP50747 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLCSP50747 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLCSP50747 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLCSP50747 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLCSP50747 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLCSP50747 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLCSP50747 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLCSP50747 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLCSP50747 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLCSP50747 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLCSP50747 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLCSP50747 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLCSP50747 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLCSP50747 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLCSP50747 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLCSP50747 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLCSP50747 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLCSP50747 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLCSP50747 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLCSP50747 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLCSP50747 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLCSP50747 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLCSP50747 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLCSP50747 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLCSP50747 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLCSP50747 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLCSP50747 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLCSP50747 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLCSP50747 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLCSP50747 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLCSP50747 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLCSP50747 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLCSP50747 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLCSP50747 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLCSP50747 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLCSP50747 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLCSP50747 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HLCSP50747 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLCSP50747 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLCSP50747 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLCSP50747 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLCSP50747 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HLCSP50747 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLCSP50747 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLCSP50747 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLCSP50747 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLCSP50747 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLCSP50747 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLCSP50747 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLCSP50747 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLCSP50747 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLCSP50747 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLCSP50747 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLCSP50747 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLCSP50747 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLCSP50747 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLCSP50747 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLCSP50747 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLCSP50747 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLCSP50747 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLCSP50747 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLCSP50747 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms