Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP4P49662 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP4P49662 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP4P49662 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP4P49662 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP4P49662 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP4P49662 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP4P49662 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP4P49662 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP4P49662 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP4P49662 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP4P49662 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP4P49662 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP4P49662 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP4P49662 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP4P49662 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP4P49662 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP4P49662 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP4P49662 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP4P49662 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP4P49662 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP4P49662 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP4P49662 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP4P49662 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP4P49662 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP4P49662 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP4P49662 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP4P49662 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP4P49662 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP4P49662 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP4P49662 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP4P49662 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP4P49662 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP4P49662 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP4P49662 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP4P49662 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP4P49662 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP4P49662 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP4P49662 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP4P49662 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP4P49662 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP4P49662 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP4P49662 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP4P49662 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP4P49662 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP4P49662 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP4P49662 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP4P49662 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP4P49662 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP4P49662 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP4P49662 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP4P49662 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP4P49662 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP4P49662 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP4P49662 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP4P49662 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP4P49662 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP4P49662 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP4P49662 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP4P49662 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP4P49662 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP4P49662 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP4P49662 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP4P49662 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP4P49662 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP4P49662 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP4P49662 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP4P49662 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP4P49662 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP4P49662 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP4P49662 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP4P49662 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP4P49662 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP4P49662 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP4P49662 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP4P49662 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP4P49662 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP4P49662 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP4P49662 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP4P49662 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP4P49662 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP4P49662 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP4P49662 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP4P49662 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP4P49662 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP4P49662 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP4P49662 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP4P49662 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP4P49662 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP4P49662 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP4P49662 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP4P49662 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP4P49662 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP4P49662 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP4P49662 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP4P49662 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP4P49662 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP4P49662 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP4P49662 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP4P49662 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms