Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ME1P48163 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ME1P48163 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ME1P48163 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ME1P48163 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ME1P48163 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ME1P48163 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ME1P48163 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ME1P48163 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ME1P48163 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ME1P48163 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ME1P48163 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ME1P48163 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ME1P48163 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ME1P48163 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ME1P48163 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ME1P48163 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ME1P48163 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ME1P48163 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ME1P48163 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ME1P48163 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ME1P48163 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ME1P48163 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ME1P48163 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ME1P48163 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ME1P48163 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ME1P48163 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ME1P48163 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ME1P48163 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ME1P48163 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ME1P48163 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ME1P48163 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ME1P48163 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ME1P48163 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ME1P48163 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ME1P48163 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ME1P48163 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ME1P48163 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ME1P48163 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ME1P48163 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ME1P48163 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ME1P48163 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ME1P48163 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ME1P48163 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ME1P48163 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ME1P48163 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ME1P48163 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ME1P48163 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ME1P48163 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ME1P48163 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ME1P48163 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ME1P48163 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ME1P48163 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ME1P48163 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ME1P48163 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ME1P48163 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ME1P48163 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ME1P48163 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ME1P48163 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ME1P48163 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ME1P48163 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ME1P48163 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ME1P48163 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ME1P48163 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ME1P48163 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ME1P48163 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ME1P48163 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ME1P48163 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ME1P48163 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ME1P48163 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ME1P48163 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ME1P48163 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ME1P48163 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ME1P48163 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ME1P48163 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ME1P48163 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ME1P48163 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ME1P48163 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ME1P48163 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ME1P48163 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ME1P48163 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ME1P48163 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ME1P48163 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ME1P48163 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ME1P48163 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ME1P48163 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ME1P48163 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ME1P48163 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ME1P48163 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ME1P48163 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ME1P48163 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ME1P48163 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ME1P48163 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ME1P48163 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ME1P48163 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ME1P48163 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ME1P48163 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ME1P48163 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ME1P48163 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ME1P48163 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms