Protein–RNA interactions for Protein: P47224

RABIF, Guanine nucleotide exchange factor MSS4, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABIFP47224 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RABIFP47224 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RABIFP47224 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RABIFP47224 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RABIFP47224 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RABIFP47224 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RABIFP47224 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RABIFP47224 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RABIFP47224 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RABIFP47224 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RABIFP47224 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RABIFP47224 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RABIFP47224 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RABIFP47224 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RABIFP47224 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RABIFP47224 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RABIFP47224 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RABIFP47224 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RABIFP47224 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RABIFP47224 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RABIFP47224 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RABIFP47224 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RABIFP47224 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RABIFP47224 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RABIFP47224 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RABIFP47224 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RABIFP47224 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RABIFP47224 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RABIFP47224 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RABIFP47224 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RABIFP47224 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RABIFP47224 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RABIFP47224 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RABIFP47224 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RABIFP47224 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RABIFP47224 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RABIFP47224 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RABIFP47224 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RABIFP47224 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RABIFP47224 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RABIFP47224 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RABIFP47224 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RABIFP47224 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RABIFP47224 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RABIFP47224 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RABIFP47224 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RABIFP47224 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RABIFP47224 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RABIFP47224 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RABIFP47224 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RABIFP47224 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RABIFP47224 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RABIFP47224 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RABIFP47224 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RABIFP47224 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RABIFP47224 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RABIFP47224 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RABIFP47224 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RABIFP47224 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RABIFP47224 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RABIFP47224 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RABIFP47224 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RABIFP47224 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RABIFP47224 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RABIFP47224 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RABIFP47224 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RABIFP47224 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RABIFP47224 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RABIFP47224 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RABIFP47224 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RABIFP47224 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RABIFP47224 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RABIFP47224 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RABIFP47224 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RABIFP47224 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RABIFP47224 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RABIFP47224 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RABIFP47224 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RABIFP47224 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RABIFP47224 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RABIFP47224 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RABIFP47224 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RABIFP47224 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RABIFP47224 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RABIFP47224 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RABIFP47224 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RABIFP47224 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RABIFP47224 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RABIFP47224 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RABIFP47224 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RABIFP47224 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RABIFP47224 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RABIFP47224 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RABIFP47224 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RABIFP47224 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RABIFP47224 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RABIFP47224 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RABIFP47224 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RABIFP47224 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RABIFP47224 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms