Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDF5P43026 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDF5P43026 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDF5P43026 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDF5P43026 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDF5P43026 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDF5P43026 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDF5P43026 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDF5P43026 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDF5P43026 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDF5P43026 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDF5P43026 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDF5P43026 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDF5P43026 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GDF5P43026 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDF5P43026 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDF5P43026 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDF5P43026 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GDF5P43026 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GDF5P43026 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GDF5P43026 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GDF5P43026 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GDF5P43026 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GDF5P43026 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GDF5P43026 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF5P43026 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF5P43026 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms