Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CAPGP40121 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CAPGP40121 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CAPGP40121 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CAPGP40121 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CAPGP40121 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CAPGP40121 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CAPGP40121 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CAPGP40121 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CAPGP40121 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CAPGP40121 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CAPGP40121 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CAPGP40121 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CAPGP40121 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CAPGP40121 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CAPGP40121 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CAPGP40121 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CAPGP40121 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CAPGP40121 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CAPGP40121 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CAPGP40121 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CAPGP40121 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CAPGP40121 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CAPGP40121 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CAPGP40121 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CAPGP40121 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CAPGP40121 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CAPGP40121 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CAPGP40121 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CAPGP40121 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CAPGP40121 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CAPGP40121 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CAPGP40121 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CAPGP40121 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CAPGP40121 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAPGP40121 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAPGP40121 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAPGP40121 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAPGP40121 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAPGP40121 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAPGP40121 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAPGP40121 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CAPGP40121 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAPGP40121 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAPGP40121 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAPGP40121 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAPGP40121 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAPGP40121 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAPGP40121 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAPGP40121 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CAPGP40121 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAPGP40121 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAPGP40121 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAPGP40121 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAPGP40121 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAPGP40121 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAPGP40121 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAPGP40121 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAPGP40121 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAPGP40121 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAPGP40121 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAPGP40121 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAPGP40121 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CAPGP40121 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAPGP40121 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAPGP40121 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CAPGP40121 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAPGP40121 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAPGP40121 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAPGP40121 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAPGP40121 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAPGP40121 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAPGP40121 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAPGP40121 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAPGP40121 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAPGP40121 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAPGP40121 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAPGP40121 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAPGP40121 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAPGP40121 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAPGP40121 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAPGP40121 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAPGP40121 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAPGP40121 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAPGP40121 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAPGP40121 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAPGP40121 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CAPGP40121 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAPGP40121 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CAPGP40121 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAPGP40121 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAPGP40121 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAPGP40121 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAPGP40121 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAPGP40121 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CAPGP40121 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CAPGP40121 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CAPGP40121 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CAPGP40121 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CAPGP40121 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms