Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms