Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5C1P36542 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms