Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms