Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms