Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms